模拟器运行游戏时，手柄能提供更直观的操作体验，提升游戏性能。许多模拟器在设计时考虑了手柄兼容性，支持多种手柄类型，包括PC常见的手柄协议和特定主机的手柄。
通用模拟器通常具备跨平台兼容性，支持常见PC手柄，如Xbox 360、PS3、Switch Pro手柄等。这类模拟器通过驱动或配置文件实现手柄映射，用户可通过模拟器内置的手柄配置工具调整按键对应关系，确保手柄操作与游戏逻辑匹配。
针对特定主机平台的模拟器，如任天堂Switch模拟器、索尼PS4/5模拟器、微软Xbox One/系列X模拟器，会优先适配对应主机的手柄协议。例如，Switch模拟器支持Switch手柄和第三方蓝牙手柄，PS4/5模拟器支持PS4/5手柄和Xbox手柄，Xbox模拟器支持Xbox手柄和PS手柄，同时通过内置配置工具实现按键映射。
手柄连接方式也会影响模拟器的支持情况。有线连接更稳定，部分模拟器支持USB有线手柄，如Xbox 360手柄通过USB连接，PS3手柄通过PS3控制器线连接。无线连接需考虑延迟和兼容性，部分模拟器支持蓝牙连接，如Switch手柄通过蓝牙连接，Xbox One手柄通过无线适配器连接，这些连接方式在模拟器中的兼容性取决于模拟器的底层驱动支持。
总结来看，通用模拟器和特定平台模拟器均支持手柄，但具体支持的手柄类型和连接方式因模拟器设计而异。用户在选择模拟器时，需根据自身手柄类型和连接方式选择合适的模拟器，并通过模拟器内置配置工具调整手柄映射，以获得最佳游戏体验。
