模拟器兼容性是衡量其性能的关键指标，直接关系到用户能否流畅运行目标平台的游戏。影响兼容性的核心因素包括目标主机的硬件架构、游戏ROM的完整性以及模拟器的代码实现精度。架构差异是首要挑战，不同主机采用独特处理器和内存管理机制，模拟器需精准复现这些细节才能保证游戏运行稳定。
经典主机模拟器的兼容性普遍优于现代主机模拟器，原因在于前者架构相对简单，开发者和社区有充足时间进行深度优化。例如，针对NES、SNES等8/16位主机的模拟器，已实现高精度渲染和内存访问模拟，支持绝大多数官方游戏及第三方作品。而现代主机如PS5、Xbox Series X的架构复杂度极高，其模拟器仍在开发阶段，兼容性受限于硬件支持和开发进度，部分游戏可能无法运行或存在严重卡顿。
社区活跃度对模拟器兼容性的提升至关重要。开源模拟器通常拥有庞大的开发者团队和用户社区，持续修复已知问题并优化代码。例如，某些经典主机模拟器通过社区贡献的补丁，解决了特定游戏的兼容性问题，使更多游戏得以运行。相比之下，闭源模拟器因开发透明度低，兼容性问题修复速度较慢，用户反馈的响应周期较长。
游戏库覆盖范围也会影响兼容性的整体表现。一些模拟器支持多个平台（如PS2、Xbox、GameCube），需处理不同架构的兼容挑战，因此其代码复杂度更高，但通过广泛测试，兼容性覆盖面更广。这类模拟器通常针对常见游戏进行优化，对冷门游戏的兼容性可能稍弱，但主流游戏的支持度较高。而专注于单一平台的模拟器，因架构单一，能投入更多资源进行深度优化，兼容性在特定领域表现突出。
硬件加速的支持是现代模拟器兼容性的重要保障。GPU加速通过将复杂计算任务交给显卡处理，大幅提升模拟器的运行效率，尤其对架构复杂的现代主机游戏。支持最新显卡API（如Vulkan、DirectX 12）的模拟器，能更好地利用硬件性能，减少卡顿和兼容性问题。此外，对多核CPU的支持也能提升多线程游戏的兼容性，使大型游戏在多核处理器上运行更稳定。
综合来看，兼容性最好的模拟器通常具备广泛架构支持、活跃社区维护、持续更新迭代和良好的硬件加速配合。经典主机模拟器因架构简单和社区成熟，在兼容性上表现优异；而现代主机模拟器虽处于发展阶段，但通过硬件支持和持续优化，也在逐步提升兼容性。对于用户而言，选择兼容性强的模拟器需关注其架构覆盖、社区活跃度和硬件支持情况，以获得最佳的游戏体验。
