密教模拟器通过构建一个七重的历史叙事来为玩家提供一个沉浸式的体验。这个结构化的历史框架将密教的漫长发展过程分解为七个关键阶段，每个阶段都代表着一个独特的时代和核心主题。
第一重历史聚焦于密教的起源与奠基。它描绘了早期密教实践从印度本土信仰和佛教密迹部中逐渐形成的时期。这一阶段强调密续的最初出现和核心教义的萌芽，为后续的复杂发展奠定了基础。
第二重历史深入探讨密教教义体系的形成与系统化。这一阶段详细阐述了“三密相应”等核心理论，以及密续中关于空性、大悲和即身成佛等概念的阐述。它标志着密教从一种仪式性实践转变为一个完整的哲学体系。
第三重历史侧重于密教仪式与修行方法的成熟。它模拟了坛城、曼陀罗等复杂仪轨的建立，并详细描述了观想、诵咒、手印等具体的修行法门。这一阶段是玩家在模拟器中进行实际操作和体验的核心内容。
第四重历史展现了密教在发展过程中形成的不同传承与宗派。它模拟了密教在印度本土以及传入中国、西藏后，分化为金刚乘、大乘密宗等不同流派的过程。每个传承都有其独特的传承谱系和核心法门，构成了密教世界的丰富多样性。
第五重历史关注密教向东亚的传播及其与当地文化的融合。这一阶段模拟了密教传入中国后，与本土道教思想结合，形成中国密宗的过程。它也描绘了密教在西藏的发展，与藏传佛教紧密融合，形成了独特的藏传密教体系。
第六重历史模拟了密教在历史长河中经历的兴衰与传承。它描绘了密教在某个时期可能因各种原因而衰落，但通过少数高僧大德的努力得以保存和复兴的历程。这一阶段强调了密教在逆境中保持韧性的精神内核。
第七重历史是整个模拟器的最终阶段，它将前六重的历史进行整合与升华。在这一阶段，玩家将体验到整个密教世界的历史脉络，理解其从起源到现代的完整发展过程。这个阶段为玩家提供了一个宏观的视角，帮助他们理解密教模拟器所构建的整个世界观。
