微生物进化模拟器2的布局围绕核心模拟流程展开，将界面划分为多个功能模块，实现操作与观察的协同。界面顶部设置菜单栏，包含文件、编辑、视图等选项，提供基础功能访问。中间区域为模拟核心区，展示微生物群体的实时状态，如个体数量、分布密度等，通过可视化图表直观呈现数据。
左侧功能面板聚焦进化参数设置，包含基因编辑、环境调控、突变率调整等模块。基因编辑区提供基因片段选择与组合功能，支持自定义基因序列；环境调控区可设置温度、营养水平等变量，模拟不同环境对进化的影响。这些面板通过拖拽或点击操作，实现参数的实时调整，确保用户能灵活控制进化过程。
右侧观察与记录区用于展示进化结果与数据统计。该区域包含进化进程图表，记录代际变化、适应度指数等关键指标；同时提供截图与日志功能，帮助用户保存重要进化阶段，便于后续分析。观察窗采用多视角设计，可切换显微镜、群体视图等模式，满足不同观察需求。
底部控制区集成启动、暂停、重置等核心操作按钮，以及速度调节滑块。启动按钮触发模拟运行，暂停按钮暂停当前进程，重置按钮恢复初始状态。速度滑块允许用户调整模拟速度，从慢速观察细节到快速推进代际，适应不同实验需求。
布局的协同性设计确保各模块间信息传递高效。例如，左侧参数调整后，中间核心区实时更新状态，右侧观察区同步显示数据变化，形成闭环反馈。这种设计降低了用户操作复杂度，提升实验效率，同时保持界面的整洁性与专业性。
