恐龙模拟器进化版本是对基础模拟模式的重大升级，核心目标是构建更复杂、更动态的生态系统，并增强玩家的干预能力。该版本不仅保留了观察恐龙自然演化的乐趣，更引入了科技元素，让玩家能够主动参与生态系统的构建与调控。
生态系统的深化是进化版本的核心亮点之一。食物链结构更加多层次，从初级生产者（如各种植物）到次级消费者（植食性恐龙），再到顶级消费者（肉食性恐龙），甚至加入了分解者（腐肉食性恐龙）和杂食性物种。物种间的互动模式更加丰富，包括捕食关系（如肉食性恐龙捕食植食性恐龙）、竞争关系（如不同植食性恐龙争夺食物资源）、共生关系（如某些植食性恐龙帮助植物传播种子，或与小型昆虫合作获取食物）。这些互动关系共同构成了一个动态平衡的生态系统，玩家需要通过观察和干预来维持其稳定。
科技元素的融入是进化版本的一大创新。玩家可以通过基因研究了解不同恐龙的遗传特征，通过基因编辑改变物种的形态、行为或生理功能（例如，让植食性恐龙更耐寒，或肉食性恐龙更擅长攀爬）。此外，玩家可以利用科技开发资源（如开采矿物、种植作物）来支持栖息地建设，或利用科技改造环境（如建造温室、改变气候模式）以适应特定物种的需求。这些科技手段为玩家提供了更多干预生态系统的工具，使其能够主动塑造恐龙世界的未来。
玩家角色的转变是进化版本的重要变化。从被动观察生态系统的自然演变，到主动干预，玩家需要设计栖息地的布局（如设置水源、植被带、隐蔽处），选择引入的物种组合（考虑食物链的平衡），管理资源分配（如分配食物资源给不同物种，避免过度捕食导致灭绝）。甚至通过科技引导物种进化方向（如通过基因编辑让恐龙适应新环境，或通过环境改造促进特定物种的进化）。这种角色转变让玩家成为生态系统的主导者，而非单纯的观察者。
视觉和交互的升级提升了玩家的沉浸感。更精细的生物模型（如恐龙的毛发纹理、皮肤质感、动态行为）和动态的环境效果（如植被生长、季节变化、天气系统）让恐龙世界更加真实。更直观的操作界面（如通过拖拽放置栖息地元素、点击查看物种数据、实时调整设置）让玩家能够轻松地参与生态系统管理。这些升级不仅提升了游戏的趣味性，也增强了玩家的操作体验。
进化版本的教育意义显著。通过模拟，玩家可以理解生物进化和生态平衡的重要性，例如过度捕食会导致物种灭绝，栖息地破坏会影响整个生态系统，不同物种间的依赖关系（如植物为恐龙提供食物，恐龙帮助植物传播种子）。这种体验能够增强玩家对自然科学的兴趣和理解，甚至激发对生态保护的关注。恐龙模拟器进化版本不仅是一款娱乐游戏，更是一堂生动的自然科普课。
