火影忍者模拟器属于动作类游戏，手柄作为核心输入设备，其操作方式直接影响玩家体验。模拟器通过手柄实现角色移动、攻击、忍术释放等核心动作，手柄绘制（即通过手柄输入控制角色动作）是游戏玩法的关键环节。
手柄绘制遵循“方向键控制位移，摇杆调整视角，扳机键触发攻击/忍术”的基本逻辑。例如，上方向键使角色向前移动，左摇杆调整镜头角度，L1/L2扳机键分别控制轻攻击与重攻击，R1扳机键用于释放特定忍术。这种操作模式符合玩家对动作游戏的熟悉度，降低了上手门槛。
不同手柄型号对火影忍者模拟器的支持存在差异。原厂手柄通过USB接口连接模拟器，通常兼容性最佳，能完美识别按键映射；第三方手柄需通过驱动程序配置按键，部分按键可能无法正常响应，影响操作流畅度。模拟器厂商通常会提供按键自定义功能，帮助玩家调整手柄设置。
手柄绘制相比键盘操作更具沉浸感。键盘输入依赖手指精准敲击，而手柄的物理按键和摇杆提供更直观的操作反馈，玩家能通过手腕和手臂动作自然控制角色，增强代入感。在火影模拟器中，手柄绘制让玩家更易执行连招和组合技，提升战斗表现。
手柄绘制的常见技巧包括“摇杆微调视角以预判敌人位置，扳机键快速切换攻击模式，组合按键释放连招”。例如，先按左摇杆调整视角锁定敌人，再按L1+R1扳机键执行“螺旋丸”连招，这种操作流程在模拟器中经过玩家优化，成为高效战斗的关键。
手柄绘制在火影忍者模拟器社区中普及度高，多数玩家选择手柄进行游戏。社区内流传大量手柄操作技巧和按键映射教程，玩家通过分享经验提升操作水平。手柄绘制带来的流畅操作和沉浸体验，成为火影模拟器吸引玩家的核心因素之一。
