手游是专门为移动终端（手机、平板）设计的独立游戏，直接在移动操作系统（如iOS、Android）上运行，由游戏公司针对移动设备特性进行开发优化。模拟器则是模拟特定游戏主机或PC平台的运行环境，让非原生设备（如手机）能够运行该平台的游戏，属于跨平台运行工具。
运行平台与硬件适配上，手游运行在移动设备的原生系统，利用手机处理器、屏幕、传感器等硬件，开发时需适配不同屏幕尺寸、电池续航、触控操作等移动端特性。模拟器需模拟目标平台的硬件架构（如PS4的x86架构），通过软件层在移动设备上实现，对硬件性能要求更高，依赖模拟器的优化程度和设备硬件（如CPU、GPU）。
开发设计与用户体验方面，手游围绕移动端交互（触屏、碎片化时间）设计，界面简洁，操作便捷，适配小屏幕。模拟器游戏通常为PC或主机平台设计，界面较大，操作（键盘鼠标/手柄）需适配，移动端模拟时可能存在操作不便（如用触屏模拟手柄）。此外，手游有内置支付、社交、更新机制，模拟器游戏可能依赖原平台的服务（如Steam），移动端体验不同。
性能表现与优化上，手游开发时针对移动设备性能优化，帧率、画质等适配移动硬件（如骁龙、A系列芯片）。模拟器运行原平台游戏，原平台游戏对移动设备性能要求高，模拟器需通过降画质、降低帧率等方式优化，或依赖更高性能的手机（如旗舰机）才能流畅运行，性能表现受模拟器版本和设备硬件限制。
生态与更新机制上，手游生态由移动应用商店（App Store、Google Play）管理，更新由开发者直接推送，版本统一。模拟器生态复杂，涉及多个模拟器软件（如PPSSPP、Citra），更新由各自开发者维护，不同模拟器对同一游戏的兼容性和优化不同，更新节奏不一。
总结核心差异，手游是移动端原生产品，模拟器是跨平台运行工具，两者在平台适配、设计理念、性能优化、生态管理等方面存在本质区别，用户选择取决于使用场景（移动端原生体验 vs 跨平台游戏需求）。
