Wii与WiiU作为任天堂的家用游戏主机，其硬件架构存在显著差异，这些差异直接影响了模拟器的开发与运行表现。Wii采用PowerPC架构的CPU，搭配硬件加速的图形处理单元，而WiiU则升级为基于ARM架构的CPU，并引入了更强大的图形处理能力，同时支持高清输出与在线功能。
Wii模拟器的开发起步较早，社区支持较为完善，现有模拟器已能较好地模拟Wii主机的运行环境，支持多数经典游戏的流畅运行。相比之下，WiiU模拟器因硬件架构的复杂性，开发难度更高，当前版本仍处于优化阶段，部分功能尚未完善。
WiiU模拟器需要处理更多游戏类型的兼容性问题，包括U盘存档、在线功能等，这些功能在Wii模拟器中并不存在，增加了模拟器的开发难度。而Wii模拟器主要关注传统Wii游戏的兼容性，技术路径相对清晰。
WiiU模拟器支持高清输出与更丰富的控制选项，例如支持手柄振动、HD震动等功能，提升游戏体验。Wii模拟器则更侧重于传统Wii手柄的模拟，界面设计更贴近原主机，部分玩家更倾向于这种熟悉的体验。
选择WiiU模拟器还是Wii模拟器，需根据个人需求与硬件条件决定。若追求高清画质与更多游戏功能，WiiU模拟器是更好的选择；若主要玩经典Wii游戏，且硬件配置有限，Wii模拟器则更为合适。
