Wii U模拟器运行游戏的核心在于解析特定游戏文件格式。Wii U游戏通常以官方发布的容器格式分发，这些格式包含游戏的核心数据、资源文件、更新信息及元数据。模拟器需识别并处理这些格式，以还原游戏运行环境。
主要格式包括WUP（Wii U Platform）文件，这是Wii U游戏的官方发布格式，结构上包含头部信息、游戏代码、资源包、更新模块等。WUP格式确保游戏数据完整性，支持数字下载及更新机制。
WAD格式在Wii U模拟器中较少直接使用，但部分更新或补丁可能采用类似结构。WAD格式源于Wii平台，包含补丁、更新包，但Wii U的WAD格式可能存在差异，需模拟器适配解析。
ISO格式作为光盘镜像，在Wii U数字版游戏中较少直接出现，但部分模拟器支持加载ISO文件以模拟物理光盘环境。ISO格式包含完整的游戏数据，需模拟器解析文件系统结构。
模拟器对格式的支持程度影响游戏运行体验。部分模拟器优先支持WUP格式，因官方发布的主流游戏采用此格式；而ISO格式因数据量较大，加载速度及解析复杂度较高，支持度相对较低。
格式转换需求源于兼容性。部分用户需将WUP转换为ISO或其他格式以适配特定模拟器，转换过程涉及文件结构重组、数据提取及重新打包，需确保数据完整性。
未来模拟器对格式的支持将随技术发展而完善。随着模拟器架构优化，对WUP等复杂格式的解析能力增强，游戏兼容性提升，进一步推动Wii U模拟器生态发展。
