系统兼容性问题可能导致模拟器无法运行。随着操作系统版本的迭代，模拟器可能因对底层API或系统服务的支持不足而无法运行。例如，较新的Windows系统引入了新的图形API（如DirectX 12或Vulkan），而旧版模拟器可能不支持这些API，导致启动失败或运行时崩溃。
模拟器自身版本问题也是常见原因。开发者可能未及时更新软件以适配新系统或修复已知问题。例如，旧版模拟器可能包含导致系统冲突的bug，或者在新系统上无法加载必要的插件或模块，从而无法启动或运行。
硬件资源限制同样会影响模拟器的运行。模拟器需要一定的系统资源，包括CPU、内存和显卡。如果用户的硬件配置低于模拟器的要求，或者系统同时运行多个高资源消耗的程序，可能导致模拟器响应缓慢甚至崩溃。例如，老旧的显卡可能无法支持模拟器所需的图形渲染，或者内存不足导致模拟器无法加载游戏ROM。
软件冲突与系统权限也可能导致问题。模拟器可能与其他已安装的软件发生冲突，例如杀毒软件、系统优化工具等可能阻止模拟器访问某些文件或进程。此外，模拟器可能需要管理员权限才能执行某些操作（如修改系统设置或加载特定驱动），若用户未以管理员身份运行模拟器，可能导致功能受限或无法运行。
配置错误与文件损坏也是常见原因。用户可能错误地设置了模拟器的参数，例如将分辨率或帧率设置得过高，超出系统硬件能力，导致模拟器运行时出现错误。另外，模拟器安装文件或游戏ROM文件可能因下载过程中损坏或存储介质问题而无法被正确读取，从而无法启动模拟器或加载游戏。
